#dayof105 Linked Dataとしてのデータ公開．RDFによるデータ公開: RDFをそのまま公開/SPARQLエンドポイントを公開．HTTP URIを使う

posted at 11:19:04

#dayof105 Web上の他の情報源にRDFでリンク

posted at 11:19:23

#dayof105 RDFリンクによってデータのWebを辿れるようになる.

posted at 11:19:59

#dayof105 LODクラウドの紹介: メディア，地理，バイオなど様々な分野のデータ

posted at 11:20:35

#dayof105 メディアデータ: NY Times, BBCなど

posted at 11:21:02

#dayof105 生命科学の例: LODD

posted at 11:21:32

#dayof105 政府データ: Open Government, data.gov, data.gov.uk, openlabs.go.jp

posted at 11:22:02

#dayof105 日本でのLOD: NDLA, biolodなど

posted at 11:23:39

#dayof105 Linked Open Dataチャレンジ2011 http://t.co/7SE751Xt

posted at 11:24:58

#dayof105 地球環境シミュレーションを行うためには多分野のデータ統合をしないといけないが，異義語や同義語などの問題がある

posted at 11:46:47

#dayof105 データ量はペタバイト単位．データの多様性とデータ量が問題．

posted at 11:47:25

#dayof105 Scientific Data Management ISIC．13年前で300TBのデータを扱う必要があった

posted at 11:49:18

#dayof105 海洋地球観測探査システム: 地球観測，災害監視，資源観測のデータ統合・解析

posted at 11:50:59

#dayof105 多様で超大容量なデータの統合，分野を超えて世界で共有できる知，体感できるデータと情報

posted at 11:53:13

#dayof105 オントロジを用いて多分野データ統合

posted at 11:54:09

#dayof105 データ収集についても力を入れている．地球観測に関するデータがアーカイブされていない

posted at 11:55:24

#dayof105 アーカイブして品質管理してメタデータを付与するデータストレージシステムを開発した

posted at 11:55:57

#dayof105 地球観測衛星いぶきのデータ，全球雲解像モデル(NICAM)との組み合わせによる地表大気のCO2解析

posted at 11:59:55

#dayof105 可視・赤外センサによる森林火災情報などを組み合わせて炭素の循環全体を観測

posted at 12:00:43

#dayof105 水循環が人間と自然を結びつけるキー．気候システムと人間による水管理システムの間に農業，都市河川管理，生物多様性などがある

posted at 12:02:28

#dayof105 311の震災のように想定を超える外力が起きるとこれが変化する

posted at 12:03:19

#dayof105 ハノイは水害で有名．紅河流域には3つの多目的ダムがある．目的は治水と利水

posted at 12:05:35

#dayof105 衛星データやモニタリングのデータなどをリアルタイムで解析して最適ダム管理をしている

posted at 12:06:26

#dayof105 そこに例えば重力の変動を観測する衛星データを持ってくる．実は重力の影響は地表面の水にでてくる．データを合わせると地下水位変化がわかる

posted at 12:07:50

#dayof105 フィリピンの渇水予測(季節予測)

posted at 12:09:12

#dayof105 (落ちた)

posted at 12:13:08

#dayof105 水循環に関するデータに都市水害や作物，生物などのデータを持ってきてよりよい予測や管理をしたい

posted at 12:14:21

#dayof105 地域のデータ管理に適用できるはず．住民参加型で洪水などのシミュレーションを行い土地利用などに活用する

posted at 12:15:43

#dayof105 GEO: the Group on Earth Observations. 86カ国61国際機関による地球観測の政府間部会．2003年から5回サミットを行なっている．世界でのデータ共有促進

posted at 12:17:11

#dayof105 Q. データ共有の制度的な問題はないのか．A. 国際機関でとっているデータは楽だが，個人研究レベルでは難しい．論文書いた後でもでてこない．論文書くときに使うところだけは品質管理するが，取得データ全体の品質管理はしないことがおおい．データ内に大量のエラーがある

posted at 12:20:06

#dayof105 GEOではデータをオープンにするを促進．USは完全オープン．EUはいくつか制限がある．日本の気象庁だと第3者に公開してはいけない．これはオープンではないが，このパターンは多い

posted at 12:21:48

#dayof105 ４省のデータ統合の話 文科省，経産省，農水省，厚労省にある生命科学関係DBの横断検索を可能にする

posted at 13:38:40

#dayof105 生命科学DBのアーカイブ，一括ダウンロード可能にする，各省でアーカイブのガイドラインを作成

posted at 13:39:27

#dayof105 アーカイブの省間連携をしやすくしたい

posted at 13:39:57

#dayof105 省間で技術交流，イベント交流(biohackathon, トーゴーの日，分子生物学会特別展)

posted at 13:40:57

#dayof105 4省合同ポータルサイト http://integbio.jp に１２月公開予定

posted at 13:41:49

#dayof105 「「画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベース」の試み」 伊藤 剛 （農業生物資源研究所　農業生物先端ゲノム研究センター ゲノムインフォマティクスユニット ユニット長）

posted at 13:45:33

#dayof105 植物・昆虫・家畜ゲノム研究の関連DB整備

posted at 13:46:24

#dayof105 イネのゲノム配列決定，コシヒカリ，オオムギ，コムギ

posted at 13:47:19

#dayof105 種内に限らず近隣種についても比較研究をしている

posted at 13:47:52

#dayof105 塩基配列，タンパク質，表現型(?)などのDB統合

posted at 13:48:42

#dayof105 膨大な塩基配列のDB・解析システムを開発してきている

posted at 13:50:25

#dayof105 生命科学データベースアーカイブについて．NDBC/DBCLSと連携．メインデータはCSV．１つのアーカイブにつき１つのメインデータでテキスト以外のサブデータが複数ある．

posted at 13:53:46

#dayof105 横断検索について．これもNDBC/DBCLSと連携．検索エンジンとしてHyper Estraierを使用

posted at 13:55:00

#dayof105 ハードディスクが大量に．置く棚の購入が追いつかない．データは1回で数TB増えることを想定

posted at 13:56:27

#dayof105 これらを踏まえて新しいシステムの導入する．解析用サーバ: 100ノード(1000コア)のクラスタで遺伝子予測，メモリ2TBのサーバ2台でゲノム断片整列化

posted at 13:59:06

#dayof105 Galaxyを一般向けサービスとして使うことを検討

posted at 14:01:46

#dayof105 ゲノム情報を活用した新規遺伝予測機能，ゲノム断片整列化=>大量のゲノム配列と表現型情報から農業上有用なものを発見予測する

posted at 14:03:33

#dayof105 ゲノム断片整列化については将来的にはウェブサービス化

posted at 14:04:21

#dayof105 Q. ゲノム解析のパイプラインを運営していく上でのノウハウなどを広めることは考えているのか A. 共有していきたい．Wikiなどで情報共有していく意義はあるのではないか

posted at 14:08:17

#dayof105 こめんと: 遺伝研でもGalaxyなどを組み合わせて色々やっているので協力していきたい

posted at 14:09:19

#dayof105 MicroDB = 微生物統合DBということでいいのかしら

posted at 16:57:09

#dayof105 Body BLAST メタゲノムデータ用

posted at 17:08:57

#dayof105 メタゲノムデータはRDFで表現されている

posted at 17:09:08

#dayof105 ゲノムデータが得られた時に関連するメタゲノムデータが視覚的にわかるようになると期待?

posted at 17:09:22

#dayof105 概算476兆トリプルって…

posted at 17:09:30